Op het Rythovius College worden ruim 25 vakken onderwezen. Deze vakken zijn ondergebracht in vijf vakgroepen: Science, Mens & Maatschappij, Sport & Bewegen, Kunst en Talen. De vakgroepen Science, Sport & Bewegen en Kunst zijn in 2010 gestart met een zogenaamde Talentenklas. In deze klas kunnen leerlingen met een meer dan gemiddelde aanleg en belangstelling voor science, kunst & cultuur of sport zich extra daarop toeleggen.